Станция обеспечивала больше половины потребности в электричестве Литвы, а также помогала развивать экономику уже независимой Литовской Республики после распада Советского Союза.
В угоду политическим амбициям, связанным со вступлением в ЕС, власти страны решили закрыть электростанцию – первый ее блок остановили в 2004 году, второй – в 2009-м. В настоящее время на Игналинской АЭС ведутся демонтажные работы.